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生物安全柜不僅可以保護樣品也可以保護操作者，所以才被成為“安全”柜。是一種負壓過濾排風柜，用于生物安全實驗室和其他實驗室的生物安全防護，可以防止操作者和環境暴露于實驗過程中產生的生物氣溶膠；對操作人員、樣品及樣品間交叉污染和環境提供安全保護。
隨著科學技術的發展和人們對生物安全意識的提高，生物安全柜在實驗室、醫院及研究單位的應用日益廣泛，但是在人們在觀念里認為是最簡單的排風設備，選型、安裝、使用等方面中存在很多問題和誤區，給生物安全防護、避免實驗室感染帶來極大的隱患。
誤區一：潔凈工作臺代替生物安全柜
目前有很多醫院在大量使用醫用潔凈工作臺，很多操作人員認為這兩種設備外形相同，作用大同小異，并認為他們操作的樣本都是普通的樣本，不具有高致病性。其實，生物安全柜和潔凈工作臺具有本質的差別，潔凈工作臺將通過高效過濾器的凈化空氣向下吹過工作區，用來保護樣品，由于工作區是正壓區，氣流通過操作窗口外溢，只保護樣品，而對操作人員和環境不提供保護，如操作含有任何已知或潛在致病氣溶膠，都會給操作人員帶來極大隱患。
生物安全柜是一種負壓凈化工作臺，可以防止操作者和環境暴露于實驗室過程中產生的有害氣溶膠，是傳染性微生物的牢籠，正確地操作生物安全柜，能夠完全保護操作人員、樣品、工作環境。因此，醫院臨床檢驗、診斷、病理分析、腫瘤藥物的配制等工作及相關生物醫學研究所、實驗室都應使用生物安全柜。同時，為了安全起見，各醫療單位及相關實驗室應重新對實驗室微生物危險度進行評估，如有潛在危險，應及時替換原有潔凈工作臺，并根據需要選配生物安全柜。
誤區二：超前化
生物安全柜選型不當，根據結構設計、排風比例和保護對象和程度不同，生物安全柜分為Ⅰ級、Ⅱ級和Ⅲ級，其中Ⅱ級又分為A2、B2型。不同級別的生物安全實驗室應選用不同級別的生物安全柜，也可根據要保護、防護的不同類型來選擇適當的安全柜。在操作少量揮發性化學試劑或放射性核素時，可選擇Ⅱ級B2型生物安全柜；操作大量揮發性化學試劑或放射性核素時，必須使用Ⅱ級B2型生物安全柜。目前全世界應用最廣的是Ⅱ級A2型安全柜，它能夠滿足醫院的一般用途，另外，從節能角度也較為經濟。在實際工作中，很多單位認為設備選型應具有一定的超前性，常常在A2型能滿足應用的情況下選用B2型，造成問題很多。安全柜的選擇應主要從安全柜的性能考慮，如高效過濾器、風路設計、報警裝置、負壓保護等指標比較安全柜的優略。
誤區三：安全柜安裝問題多多
現有實驗室購置安全柜，一般在房間騰出一小塊空地安放，存在問題很多，安裝位置不當，會造成污染。生物安全柜兩側、后側應留30cm，頂部留出足夠30~34cm的空間；為減少氣流擾動，保證安全柜正常工作，生物安全柜應放置在遠離實驗室入口、門窗、暖氣、走道，避開送風口，避免外界氣流對柜內氣流造成擾動。生物安區柜放置的房間必須有足夠的送風量，Ⅱ級A2排氣量約在700~1200m3/h，B2則在1000~1600 m3/h,有的型號更高，如果沒有足夠的補充送風，生物安全柜所在房間成為高負壓狀態，生物安全柜無法正常工作。很多實驗室購置Ⅱ級A2生物安全柜后，認為排風管道接到室外比排到室內安全。其實，生物安全柜排風出口帶有高效過濾器，所排出的氣體被證明是安全的，對室內環境沒有影響；另外，將室內舒適工作環境的潔凈空氣排到室外會大大增加運行成本，因此，除了操作危險度較高的實驗對象或能產生化學氣味的化學試劑，Ⅱ級A2生物安全柜排風排到室內是安全可行的。
Ⅱ級A2型生物安全柜采用硬連接，這種連接方式以前被廣泛使用，A2型生物安全柜使用密閉硬管連接到帶抽風機的排風系統時，其安全運行完全依賴于排風系統，如當排風的速度升高或降低，生物安全柜內不平衡發生變化，會產生污染環境、樣品的嚴重后果。在美國NSF49:2002標準中禁止Ⅱ級A2生物安全柜使用密閉硬管連接。如果Ⅱ級A2安全柜外排氣體時，建議排風管采用套管連接，套管安裝在生物安全柜的排風管上，與安全柜高效過濾器之間保留2.5cm的縫隙，以便讓房間的空氣也能吸入到建筑物的排風系統中，這種連接方式是最安全的連接方式，柜內的氣流平衡獨立與排風系統，無論排風系統如何波動柜內氣流平衡都不會受到影響。Ⅱ級B2必須通過硬管連接，密封地連接到排風系統上，排風系統的排風量和靜壓必須與安全柜制定要求一致。在安裝有多臺Ⅱ級B型生物安全柜時，應各自使用獨立的排風管道，不能共用排風管道。
